近代
薩非之後統治這個地區的是伊朗的阿夫沙爾王朝和桑德王朝以及短暫統治這個地區的卡扎爾王朝，它所統治的北亞塞拜然這塊土地在19世紀初期戰敗後割讓給了俄羅斯帝國，然而，特別是在桑德王朝崩潰和卡扎爾王朝早期的時候，這塊地域出現了許多在實際上是自治的高加索汗國[54][55][56][57][58]。
18-19世紀初作為波斯附庸的高加索諸汗國（英語：Khanates of the Caucasus）
公元3世紀，亞塞拜然處於波斯人的統治之下，公元642年被阿拉伯哈里發國（阿拉伯帝國）征服。公元11至13世紀亞塞拜然民族形成，9－16世紀遭受突厥人、蒙古人和波斯人的入侵。
1804年俄軍入侵波斯北疆的占賈圍城戰
18世紀歷經彼得大帝和凱薩琳大帝富國強兵後的俄羅斯帝國迅速強大，於18世紀下半開始威脅波斯北疆。在和波斯帝國進行長達30年的戰爭後，1828年亞塞拜然的北部歸併於俄羅斯，南部則作為波斯的一個省保留了下來，該年簽訂的土庫曼恰伊條約確立了沙俄與波斯的疆界。從19世紀中葉起，巴庫的石油開採很大地抬升了外高加索的經濟實力。到1900年，巴庫成為世界首屈一指的石油中心，連帶使各國的無產階級匯集此地，形形色色的社會主義和馬克斯主義思潮將此地攪擾得動盪不安。
1917年俄國革命之後，11月建立了從外高加索民主聯邦共和國獨立的亞塞拜然民主共和國，但此共和國先後被英國人（1918年8-9月）、鄂圖曼帝國（9-10月）、英國人（12月）給占領。同時亞塞拜然還跟亞美尼亞民主共和國爭奪納卡地區的控制權而發生邊境戰爭。
1920年蘇俄紅軍占領亞塞拜然，4月28日成立亞塞拜然蘇維埃社會主義共和國，1922年3月12日同喬治亞、亞美尼亞組成外高加索蘇維埃社會主義聯邦共和國，同年12月30日該聯邦共和國加入蘇聯，1936年12月5日改為直屬的蘇聯加盟共和國之一。
1990年「黑色一月」時進駐巴庫以鎮壓獨立運動的蘇聯坦克
亞塞拜然的精英在史達林的大清洗政策時大批死亡，共產黨對宗教人士的虐待也是頗為嚴酷，但在二戰時蘇聯的衛國戰爭中，亞塞拜然動員1/5的人口參戰：約68萬人上前線（其中有10萬名婦女），25萬人戰死，而當時亞塞拜然的人口則是340萬。1969-1982年在經濟衰退的背景下，亞塞拜然共產黨第一書記阿利耶夫採取強硬方針宣誓肅貪，但沒能阻止官僚主義和腐敗的蔓延。1990年1月，受東歐劇變影響，亞塞拜然人的獨立運動已在兩年內急速攀升，反亞美尼亞人的種族屠殺運動（巴庫為中心）導致蘇聯紅軍在當年一月進駐巴庫並造成傷亡與破壞，史稱「黑色一月」（約147位平民被紅軍殺死、800人受傷），這次鎮壓削弱了民族獨立運動，直到1991年蘇聯的八月政變爆發，才給亞塞拜然完成獨立的良機。1991年8月30日宣布獨立，成立亞塞拜然共和國。
卡拉巴赫的亞塞拜然士兵
1991年9月，亞塞拜然境內具有爭議、以亞美尼亞人為主體的納戈爾諾-卡拉巴赫區域，重申了它們自願想要脫離亞塞拜然的宣言[59]。在法理上被國際廣泛認作是亞塞拜然的領土自1991年的納戈爾諾-卡拉巴赫戰爭爆發一直被阿爾察赫共和國占據，1994年簽署停火協議後，由歐洲安全與合作組織推動談判解決納卡問題[60][61][62][63]，於2020年納戈爾諾-卡拉巴赫戰爭結束之際，三分之二部分被亞塞拜然政府收回。2023年9月，亞塞拜然對納戈爾諾-卡拉巴赫的阿爾察赫共和國發動攻勢，2023 年 9 月 28 日，阿爾察赫共和國總統薩姆韋爾·沙赫拉馬尼揚宣布阿爾察赫共和國將於2024年1月1日停止存在[64][65]，大量亞美尼亞人逃離納戈爾諾-卡拉巴赫[66]。2023年10月15日亞塞拜然總統伊利哈姆·阿利耶夫訪問了納戈爾諾-卡拉巴赫地區，並在以前用作阿爾察赫總統府的建築上正式升起亞塞拜然國旗[67]。
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